高速离心机的振动是衡量离心机性能优劣的重要标志之一。通常，减振可采取主动减振和被动减振二种方法。主动减振就是在设计中将离心机的工作转速远远避开旋转系统的临界转速(实验室用高速离心机一般均将临界转速设计为远远低于工作转速)。另外，在转子加工过程中一定要进行动平衡。被动减振就是以各种型式的减振器将可能产生的振动与机架和基础隔开。
　　
　　一般在离心机设计中，高速冷冻离心机主动减振和被动减振是同时应用的对高速离心机而言，一般可在三个部位考虑减振：①将主轴轴承座设计成挠性减振型式；②主轴与电机之间以挠性联接；③整个驱动系统与机架挠性联接。
　　
　　橡胶减振器一般即可满足高速离心机的减振要求。在减振器结构已定的情况下，橡胶硬度越大，系统的临界转速就越高。硬度太低的减振器，强度不能满足要求，容易损坏。
　　
　　除以上三部位采用挠性减振型式外，高速离心机转头和主轴之间还可采用弹性接合，比如在高速冷冻离心机的主轴和转头之间有一层硅橡胶(SiliconeRubbet)，它可进一步吸收振动。各种减振措施除起到隔振作用外，还使旋转系统的临界转速下降，从而使工作转速远远避开临界转速。